MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes FSL R2-561 chromosome

Total Repeats: 8476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017546	T	6	6	158	163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017546	TACAT	2	10	228	237	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017546	G	7	7	243	249	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017546	GCA	2	6	1680	1685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017546	CTATTA	2	12	1722	1733	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017546	T	6	6	1740	1745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017546	ATTA	3	12	1746	1757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017546	A	7	7	1784	1790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017546	A	6	6	2955	2960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017546	T	7	7	2991	2997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017546	A	7	7	4411	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017546	T	7	7	4440	4446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017546	AATA	2	8	4448	4455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017546	C	6	6	4460	4465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_017546	A	7	7	4478	4484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017546	AT	3	6	4497	4502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017546	TGA	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017546	AAAG	2	8	5942	5949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017546	AAT	2	6	5958	5963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017546	TAA	2	6	7922	7927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017546	TTA	2	6	7933	7938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017546	T	7	7	10579	10585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017546	A	6	6	10592	10597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017546	A	6	6	10642	10647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017546	A	7	7	12759	12765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017546	TAA	2	6	12772	12777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017546	A	6	6	12788	12793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017546	TAT	2	6	12822	12827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017546	AGT	2	6	15817	15822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017546	T	7	7	15847	15853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017546	AT	3	6	15912	15917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017546	A	6	6	16000	16005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017546	T	7	7	16015	16021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017546	T	6	6	16045	16050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017546	CTT	2	6	16075	16080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017546	G	6	6	17265	17270	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017546	ACTT	2	8	19373	19380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017546	GGCT	2	8	19393	19400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017546	CAG	2	6	19419	19424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017546	TAA	2	6	19449	19454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017546	AGT	2	6	19475	19480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017546	TTG	2	6	19575	19580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017546	TTC	2	6	19655	19660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017546	CTA	2	6	19664	19669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017546	TATT	2	8	19770	19777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017546	TGT	2	6	19804	19809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017546	ATTTTC	2	12	19814	19825	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017546	CTC	2	6	21368	21373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017546	T	6	6	21436	21441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017546	A	7	7	21498	21504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017546	ATT	2	6	21510	21515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017546	GAG	2	6	21572	21577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017546	TCA	2	6	23042	23047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017546	A	6	6	24057	24062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017546	CG	3	6	24101	24106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017546	AAG	2	6	25781	25786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017546	GGA	2	6	27416	27421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017546	T	6	6	28172	28177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017546	AAAT	2	8	28840	28847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017546	A	7	7	28855	28861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017546	AT	3	6	28887	28892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017546	TCA	2	6	28898	28903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017546	A	6	6	29004	29009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017546	AGGA	2	8	29018	29025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017546	GTC	2	6	29027	29032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017546	TAAA	2	8	30947	30954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017546	A	6	6	31001	31006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017546	T	6	6	32017	32022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017546	T	7	7	32044	32050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017546	T	6	6	32077	32082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017546	GAAA	2	8	32099	32106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017546	A	6	6	32115	32120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017546	A	7	7	32475	32481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017546	T	6	6	32500	32505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017546	CCTT	2	8	33322	33329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017546	CAA	2	6	34542	34547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017546	AGG	2	6	40438	40443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017546	TCT	2	6	40454	40459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017546	A	7	7	40524	40530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017546	AAT	2	6	40546	40551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017546	ATG	2	6	40564	40569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017546	AAAT	2	8	40617	40624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017546	AGG	2	6	41679	41684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017546	AGA	2	6	41685	41690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017546	C	6	6	41710	41715	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_017546	AGG	2	6	45246	45251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017546	ATAA	2	8	47180	47187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017546	GACTT	2	10	47209	47218	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017546	TAAA	2	8	47242	47249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017546	AGTG	2	8	47259	47266	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017546	T	8	8	47940	47947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017546	TC	3	6	47961	47966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017546	TTAG	2	8	47993	48000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017546	TTG	2	6	49293	49298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017546	ATA	2	6	49376	49381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017546	ATT	2	6	49403	49408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017546	GCTC	2	8	49413	49420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017546	ATGGT	2	10	49463	49472	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017546	AGG	2	6	49505	49510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017546	GAG	2	6	49853	49858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017546	AGG	2	6	50436	50441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017546	T	6	6	50726	50731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017546	AAG	2	6	50770	50775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017546	TATT	2	8	50787	50794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017546	TA	3	6	50806	50811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017546	A	7	7	50817	50823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017546	T	8	8	51496	51503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017546	TAAA	2	8	51519	51526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017546	TAT	2	6	51550	51555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017546	A	6	6	51596	51601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017546	T	6	6	51617	51622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017546	TTA	2	6	51665	51670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017546	TAAAA	2	10	52502	52511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017546	GGA	2	6	52555	52560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017546	T	7	7	54628	54634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017546	TGA	2	6	54656	54661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017546	ATA	2	6	54682	54687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017546	TGA	2	6	54689	54694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017546	GTTA	2	8	54698	54705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017546	TTATG	2	10	54709	54718	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017546	A	7	7	54752	54758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017546	AAT	2	6	60129	60134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017546	ATA	2	6	60420	60425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017546	CAA	2	6	60739	60744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017546	CATA	2	8	60754	60761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017546	T	6	6	60798	60803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017546	TA	3	6	60850	60855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017546	A	6	6	60855	60860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017546	A	7	7	64865	64871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017546	A	6	6	75246	75251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017546	ATAGC	2	10	75615	75624	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017546	CAA	2	6	75636	75641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017546	AAC	2	6	75668	75673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017546	GTA	2	6	75681	75686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017546	A	7	7	76113	76119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017546	ATA	2	6	76130	76135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017546	A	6	6	76145	76150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017546	A	6	6	76167	76172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017546	A	7	7	76174	76180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017546	ATC	2	6	76925	76930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017546	GTA	2	6	76975	76980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017546	TAGT	2	8	77009	77016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017546	TTTA	2	8	77033	77040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017546	ATTTAT	2	12	77058	77069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017546	GAT	2	6	77398	77403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017546	T	6	6	77473	77478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017546	ATT	2	6	77489	77494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017546	A	6	6	77574	77579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017546	CCA	2	6	77637	77642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_017546	AT	3	6	77709	77714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017546	AGTAG	2	10	77738	77747	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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